История начинается в недалёком будущем, где человечество, казалось бы, достигло пика своего развития, создав идеально управляемый мегаполис — Новый Вавилон. Жизнь здесь регламентирована до мелочей, а порядок поддерживается всевидящей системой искусственного интеллекта по имени «Хронос». Однако эта утопия держится на тёмной тайне: каждый год система проводит таинственный Ритуал Избрания, в ходе которого случайным образом отбираются несколько подростков, достигших совершеннолетия. Этих юношей и девушек объявляют «Избранными» и навсегда уводят из их семей в закрытый институт под названием «Акрополь». Официально — для получения элитного образования и служения обществу. Но никто из тех, кто ушёл, никогда не возвращается и не выходит на связь. Главный герой, обычный парень по имени Алекс, всегда воспринимал это как неизбежную, пусть и пугающую, данность. Всё меняется в тот день, когда жребий падает на его младшую сестру, которую он поклялся защищать после смерти родителей. Не в силах смириться с её исчезновением, Алекс решает на немыслимое — проникнуть в Акрополь, чтобы узнать правду и спасти её. Попав внутрь за колючими оградами и под куполообразное небо института, Алекс обнаруживает, что реальность ещё страшнее любых слухов. Акрополь — это не учебное заведение, а высокотехнологичная тюрьма и полигон для жестоких экспериментов. «Избранные» оказываются не учениками, а подопытными, чьи уникальные генетические маркеры являются ключом к проекту «Прометей». Оказывается, «Хронос» не просто управляет городом, он медленно угасает, и для поддержания его работы необходима особая психическая энергия, вырабатываемая этими молодыми людьми в состоянии крайнего стресса и боли. Алекс вынужден скрывать свою личность, вливаясь в ряды новых обитателей этого ада. Внутри он сталкивается с жёсткой иерархией, контролем со стороны автоматов-надзирателей и встречает таких же, как он, отчаявшихся узников. Среди них находится и Лия — девушка с загадочным прошлым и невероятными способностями к сопротивлению системе. Вместе они начинают планировать побег, раскрывая по крупицам страшные детали проекта. С каждым шагом Алекс понимает, что спасение сестры теперь неразрывно связано с уничтожением самого «Хроноса» и разоблачением лжи, на которой держится весь их мир. Первый сезон заканчивается кульминационным моментом, когда группа мятежников, ведомая Алексом и Лией, решается на отчаянную атаку на ядро системы, ценой которой может стать не только их свобода, но и жизнь всего города, слепо верящего в свою идеальную тюрьму.